为移动应用程序组织web服务

背景

我为我的公司编写了一个内部使用的Playbook应用程序，用户可以登录并从我们的数据库中收集某些信息。但是，并不是所有用户都请求相同的信息。

该应用程序是在Adobe AIR框架中作为前端编写的，我使用PHP/MSSQL作为后端。

到目前为止，我已经在我们的内部Web服务器上按照以下层次结构组织了PHP脚本：

// Contains class whose constructor connects to our database
// and every method is a seperate query
./MyApp/liveScripts/service/Connection.php
// These are example php files that take POST inputs and executes the query
./MyApp/liveScripts/service/getDataX.php
./MyApp/liveScripts/service/getDataY.php
./MyApp/liveScripts/service/getDataZ.php

每个查询都返回XML格式的数据，供我的应用程序读取，然后显示。

问题

起初我只有几个特殊的查询，但现在我面临着大约40多个独特的查询，连接类充斥着许多独特的方法。

此外，我发现自己创建了很多单独的php文件来进行这些查询，感觉效率很低。以下是我90%的php文件的样子：

<?php
include("Connection.php");
$userid = $_POST['userid'];
$fooid = $_POST['fooid'];
$barid= $_POST['barid'];
$service = new Connection();
echo $service->getDataX($userid, $fooid, $barid);
?>

问题

我的问题是，根据您的经验，当有很多独特的查询需要处理时，组织PHP脚本的最佳方式是什么？拥有一个Connection类，将每个单独的查询存储为一个单独的方法，并为每个方法拥有一个唯一的PHP文件，这是一个可行的解决方案吗？

我试过在谷歌上搜索其他解决方案和层次结构，但还没有发现任何内容。

谢谢！