过去，我曾使用apache+mod_php+xdebug+netbeans开发我的网站（服务器是我的本地机器，运行Debian Squeeze），很高兴xdebug工作如常，调试会话可以在我需要的时候随时启动和停止。但是，当我转到nginx+php_fpm+xdebug+netbeans时，我遇到了一些调试问题。
- 我的调试会话可能会非常长（远远超过30秒），而且nginx似乎不能等待这么长时间，它显示"504网关超时错误"。我已经尝试了很多解决这个问题的建议，但没有成功。不过，这对我来说并不是很重要，因为调试会话本身仍在继续运行，这只是一件有点不舒服的事情
- 我的调试会话只能运行一次，所以，如果我停止它，并尝试再次启动调试，netbeans就无法接受来自xdebug的连接（它写着"等待xdebug连接"，而且是永远的）。重新启动netbeans后，调试会话可以再次正常启动
- 在我无法理解的情况下，调试是"为所有php脚本打开"，并阻止任何其他脚本运行。例如，我在我的网站上启动调试会话http://mysite.local/index.php一段时间后，我注意到我的管理员（位于intranet.local/adminer.php上）没有运行，浏览器试图加载页面一段时间，然后显示"504网关超时错误"。如果我看到这种行为，我可以停止netbeans中的xdebug调试会话，并且所有其他脚本开始正常运行
现在，当我写这个问题的时候，我做了一些调查，发现如果我开始调试会话几秒钟，之后停止它，然后重新开始——它会正常启动。问题似乎是在经过一段时间的主动调试后出现的。
我的系统和应用程序：Debian挤压：2.6.32-5-686Nginx:1.4.1（来自dotdeb存储库）php5-fpm:5.3.26-1~d（来自dotdeb存储库）php5-xdebug:5.3.26-1~d（来自dotdeb存储库）netbeans:7.3
我的配置：
- nginx基本配置：https://gist.github.com/MihanEntalpo/6229801
- nginx网站配置文件：https://gist.github.com/MihanEntalpo/6229781
- fastcgi_params文件：https://gist.github.com/MihanEntalpo/d93fd4105573e1eda56f
- php-fpm池配置文件：https://gist.github.com/MihanEntalpo/6229820
- php fpm xdebug配置文件：https://gist.github.com/MihanEntalpo/6229836
- netbeans：选项，这与apache服务器相同：
- 第一行中断=OFF
- 弹出窗口中的评估=打开
- 显示请求URL=ON
- 端口=9000
在nginx的错误日志文件中记录，当它无法等待脚本被调试时，或者其他脚本被问题#3锁定时，前面提到：
2013/08/14 14:40:16[error]4822#0:*111上游超时（110:连接超时），从上游读取响应标头，客户端：192.168.100.1，服务器：intranet.local，请求："GET/adminer.php？username=root&db=devel&table=user HTTP/1.1"，上游："fastcgi://127.0.0.1:9999，主机："intranet.local"，引用者：https://intranet.local/adminer.php?username=root&db=devel"
php-fpm的日志不包含任何错误消息。。。
我不喜欢用我的问题打扰任何人，总是试图自己解决。但在这种情况下，我和这些人斗争了几个月，运气不好。。。如果有人遇到这个问题，或者有与nginx+php-fpm+xdebug+netbeans一起使用的工作配置，请帮助我：）
感谢所有试图朝着我的问题的方向思考的人。我已经成功地解决了它。
- 第一个问题（504错误）可以通过nginx选项fastcgi_read_timeout来解决，例如，它可以是
fastcgi_read_timeout 600;来告诉nginx它应该等待600秒。它应该放在主机的配置文件中，或者放在/etc/nginx/fastcgi_params（Debian中）中 - 第二个问题是由我的xdebug.conf中的选项
xdebug.remote_autostart=1;引起的，它应该是xdebug.remote_autostart=0;。我不理解这个选项的真正含义，但它可以做到以下几点：任何php脚本都会自动尝试连接到调试器（在我的例子中是netbeans）。因此，在某些情况下，netbeans丢失了一个连接，当我按下"开始调试"时，它不知道是否应该打开新的连接，并永远等待xdebug客户端。现在，有了上面提到的选项，我可以在需要的时候随时启动和停止调试 - 第三个问题与第二个问题的来源相同。在我的服务器上运行的所有其他脚本都试图连接到netbeans，但由于连接丢失，这是毫无意义的
不管怎样，我希望这能帮助到那些想解决类似问题的人。StackOverflow通过强迫我明确描述我的问题来帮助我，在这个过程中，我对尝试什么有了新的想法。
当更新fastcgi_read_timeout时，您可以增加服务器上所有站点的时间限制（在我的情况下是流浪家园VM），一旦您将SSH连接到VM中，您可以执行以下操作：
sudo pico /etc/nginx/nginx.conf
并添加
fastcgi_read_timeout 300;
到http部分。
对于每个有相同问题的人来说，接受的答案不起作用，在我的情况下，是最近安装的一个应用程序阻塞了xdebug。
我的公司可以远程访问在我的笔记本电脑上安装安全软件，所以他们安装了ESET Endpoint Security.app和ESET Remote Administrator Agent.app，这显然也过滤了本地主机连接。我花了两天时间才终于注意到有一个ESET守护进程在127.0.0.1:9000上运行并阻止连接。
解决方案是删除这两个应用程序，因为我没有必要的管理权限在应用程序设置中禁用过滤。