无法使用php执行命令行 - Cannot execute command line using php

Cannot execute command line using php

本文关键字：执行命令行 php | 更新日期: 2023-09-27

我尝试运行本地BLAST的命令行。我已经下载了软件包，并允许对每个文件和文件夹进行访问。但是我仍然无法在我的页面上显示它的输出。

echo shell_exec("/opt/lampp/htdocs/blasto/bin/blastp -query /opt/lampp/htdocs/blasto/result/INF2dWxh -db /opt/lampp/htdocs/blasto/db/*.faa -evalue 10 ");

希望有人能帮我。

shell_exec将只返回STDOUT。除非在命令末尾添加2>&1，否则写入STDERR的任何错误消息都将丢失。这将把写入STDERR（文件描述符#2）的任何内容重定向到STDOUT（文件描述符#1），STDOUT将由shell_exec返回并由echo显示。所以，试试这个。。。

echo shell_exec("/opt/lampp/htdocs/blasto/bin/blastp"
    . " -query /opt/lampp/htdocs/blasto/result/INF2dWxh"
    . " -db /opt/lampp/htdocs/blasto/db/*.faa"
    . " -evalue 10"
    . " 2>&1"
);