我正在做一个项目，包括服务器和网站设计。因为我的项目包括php文件接收ajax请求，php文件包含类等等，我想知道我应该在哪里存储这一切，因为我知道通常html, js和css文件去文件夹像www/website/js, www/website/css, www/website/img等。但是用户不应该知道它们在哪里，也不应该有访问权限的文件，我应该把它们放在哪里呢?
将它们放在通过链接"http://wwwexample.org/"访问的目录之外——index.html或index.php文件所在的目录就是这个目录。就像你的例子中的"www/website"。任何上一级的目录(如"www")都是合适的，或者在那里创建的任何其他目录。
www/
|- website/
| |- index.html
| |- js/
| |- jquery.js
|
|- secure-data/
|- passwords.php
请注意，你必须把一些PHP脚本到网站目录，以允许用户访问他们，但你通常只放一个短代码到他们，以允许从这个目录外加载更多的代码。访问PHP文件有一个很大的不同:一种方式是通过web服务器，另一种方式是通过文件系统-通过web服务器的方式更受限制，即你不能去任何地方，你必须呆在目录下的区域web服务器呈现给世界。